首先，军舰第一感观就是它密密麻麻的天线，其中对空搜索雷达对海搜索雷达气象雷达，火控雷达等等。现在的相控阵雷达功能很好，先进，具备多功能同时对海对空搜索。你的问题主要依靠对海搜索雷达来解决的。一旦发现海面的小型快速目标，雷达是第一时间反应的，将情况发送发主控中心，那么值班人员此时就是上报，或则舰长在备装备就会下达命令。那么这种背后出现小艇的问题肯定在平时的训练科目里，解决方案有多种，舰长可以根据情况选择一种方案来解决它。比如在危险海域，那么第一时间武器通电备便，雷达锁定目标，计算机算出适用火炮还是导弹还是派遣直升机还是搭载陆战队的小艇，这要根据海况气象条件来决定，这个时候处于警戒状态高度集中，在对方还未对自己产生危害距离时候会通过公用频率呼叫，如果呼叫无应答，在处于危险距离时候就会作出反应，对付小块目标密集阵是最好的武器，一个满舵，舰身一横，火控雷达一锁定开火就完事了。
1、现代军舰侦察手段发达，只要军舰处于巡航或作战状态，不会有被小船突袭的情况，就像不存在高手被 菜刀架在脖子上的情况，除非特殊情况（参考美军军舰被炸，比如美国海军科尔号驱逐舰在港口补给时被橡皮艇炸伤）
2、即使有小艇混迹于其他船只或利用地形优势靠近，现代军舰也有办法应付：
（1）侧身利用舰炮攻击 ，
（2）利用副炮或重机枪攻击
（3）利用直升机攻击
（4）引导其他船只进行攻击
（5）其他可以利用的武器（猜想比如我军特有的反潜火箭、深水炸弹等）
（6）军舰上的作战部队使用武器进行攻击（比如机枪、震爆弹、火箭等）
敌人小艇高速从后方逼近，试想丢一个标深比较浅的深水炸弹，是个什么壮观的景象。
其实现代军舰打小艇有N多种方法。
战舰一但进入战区，远程预警雷达功率全开(对空最大测距1000千米以上)，被动声纳也在努力监听着各种信号，舰载直升机也是带弹升空巡逻，直升机可以挂载雷达吊仓，这样直升机又有预警功能。
举个例子:一但预警雷达发现目标，就会对其跟踪，达到400千米时，对空搜索雷达功率全开会进一步判断是否是需要处理，并进行跟踪，求证对其呼叫，确定身份。
即使是远程预警雷达未能发现，近程预警雷达也会在200~300千米作出告警。
只要近入200千米，火控雷达会精准锁定目标，对其警告处理，如果是对方未能作出合理解释，在170千米就可以发射导弹击落，如果是未能拦截成功，继续跟踪，在50千米再次拦截。
针对1000吨以下的舰艇，我们有鹰击-9轻型反舰导弹，直升机可以带4枚，西方世界也有类似的轻型反舰导弹，直升机会在距离目标15千米发射导弹把小型目标摧毁。
现代战舰靠着先进的眼睛(雷达)和耳朵(声呐)，对战场的感知能力，绝对不会让这些危协靠近，即使是真有小艇靠近，也能及时转向把主，副炮对准目标，迅速消灭。
主炮射角其实很大，不需要把船横过来，稍微斜一点就好，对付小艇，密集阵效果会更好，甚至是在舰艇两侧会有小口径自动火炮或大口径机枪，对小艇的毁伤也是致命的。
我是萨沙，我来回答。
很容易对付的。
第一，用直升机对付。
现在各种大型军舰对付小艇，都是使用直升机。
直升机的航行很远，可以在距离军舰上百公里进行巡逻。
一旦发现小艇，直升机可以在距离自己军舰几十公里外，轻松将小艇击沉。
它可以使用的武器很多，即便用机关炮扫射也是可以击沉的。
在伊朗海军和美军对峙期间，美军曾用直升机击沉过多艘伊朗小艇，己方毫发无伤。
第二，用反舰导弹。
用鱼叉之类反舰导弹，击沉这种小艇也没有什么问题，但性价比不够。
目前美军使用“地狱火”反坦克导弹的改进型号，射程不到10公里，不能对付大型军舰，只能对付小型军舰和快艇。
它的优点是便宜且命中率高，对付小艇是很厉害的。
第三，使用主炮。
现代化军舰都有雷达监控，小艇的行动轨迹都被掌握。
当小艇靠近时，军舰只需要转向，用舰首主炮进行轰击即可，一二炮就可以击沉。
第四，使用近防炮。
近防炮是没有死角的，而且有一定反舰能力。
钨芯穿甲弹对付没有防御力的小艇，还是很轻松的。
缺点是，此时小艇已经靠的比较近了，存在一定的风险。
因为近防炮主要是用于防空，对海近距离攻击不是主要功能。
如果海上风浪较大，小艇是那种高速汽艇可以灵活机动，然而采用撞击式自杀攻击，使用近防炮有一定打不中的危险。
第五，使用重机枪。
其实，普通小艇也就是装备一些重机枪、火箭筒之类，主要用于骚扰敌人，而不是攻击。
而军舰基本都配备大口径重机枪，小艇靠近如果威胁不大，就用机枪扫射迫使其离开即可。
还有更狠的，看上图。
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