朱元璋和努尔哈赤，分别是两个大一统王朝的太祖。无疑，他们都是十分优秀的军事指挥家。虽然两者生活的时代相距二百多年，经过潜心分析，如果把清太祖定位为卓越的军事家，那么明太祖就近乎天才的军事家。
下面，从六个方面加以剖析。
第一，两人的起点有高低
明太祖出生赤贫，他的父母逝世后，连一块葬身之地都没有。好心的邻居刘继祖借给他一块坟地，他才得以把父母草草安葬。为了活命，他舍身出家皇觉寺，后又因为当地闹饥荒，不得不做了化缘僧，以行乞度日。
在这种情况下，明太祖没有接受一天的正规教育，并且长期衣食无着，他的体质应该也不会太强壮。
清太祖的生存状态要好些。他的祖父觉昌安曾经是建州左卫的领袖，后来随着建州右卫王杲的崛起，他的日子很不好过，就跟随王杲一起混。
从史料记载分析，觉昌安和明朝很亲，做生意很有一套，属于没什么野心、“素食”的那类人。并且，他的身份属于明朝派遣打入建州右卫的自己人。很可惜，在李成梁剿杀王杲儿子阿台的战役中，觉昌安和努尔哈赤的父亲塔克世在城破之时被明军误杀了。
努尔哈赤的生母在他十岁时过世，他受过继母那拉氏的虐待，被逼到山上去挖人参、采松子。所以说，在他青少年时期，是喝着山泉水、啃着人参长大的，想必身体很棒。
《东夷考略》中说：“奴儿哈赤方幼，李成梁直雏视之。”
《建夷授官始末》中也说：“时努尔哈赤十五六，抱梁马足请死，成梁怜之，不杀，留帐下如养子，出入京师，每挟奴儿与俱。”
从上面二则记载看，努尔哈赤在十多岁时曾有过被李成梁俘虏的经历，他很会来事，搏得了成梁的好感。李成梁让他做儿子们的侍读，还带他到京师去增长阅历。
出于对努尔哈赤父、祖之死的愧疚，李成梁归还努尔哈赤祖、父遗体，并给他“敕书三十道，马三十匹，封龙虎将军，复给都督敕书”。
努尔哈赤后来宣称自己以十三副盔甲起兵，其实，他那时已经是部落的首领，还在《三国演义》和《水浒传》两本书中涉取了丰富的军事知识。
总之，相较于明太祖，清太祖的起点更高些。
第二，时代风芒不一样
朱元璋就不多说了，在他的时代，那是遇神杀神、遇佛杀佛，百无禁忌，一马平川。
努尔哈赤虽然说也十分牛，但他至少有克星，这就是说传说中的“一座城”、“一个人”。
一座城指的宁远、一个人说的是袁崇焕。当年，爱新觉罗先生携连克辽沈七十城的余威、兵锋直指宁远城。他碰到了一个生荒子，这个生荒子的心理素质很好，可着劲地架起红夷大炮放。一个不小心，先生让炮弹咬了，八个月后，含恨而逝。
而传奇的宁远城，不仅坑了清太祖，还坑了清太宗。以至后来吴三桂孤军守宁远，皇太极楞个不敢打，发动一系列的劝降攻势。初步统计，仅劝降信就写了不下二十封，清太宗还亲自操刀写了一封，因为明朝彼时还没亡，吴三桂就没怎么理这些说客。
第三，工作效率不一样
朱元璋25岁从军，15年后，登基称帝。同年，攻破元大都。
清太祖同样是25岁起兵，经过33年的征战，建立后金。有一点缺憾就是：至努尔哈赤身死，没有搞定女真叶赫部，其铁骑也没有触摸到明长城。
第四，明太祖的军事指挥技能更全面
努尔哈赤终其一生，都是在陆地上叱咤风云，虽然女真人也有渔猎的生存技能，但他没有指挥过水战。
朱元璋军事生涯中的胜负手是鄱阳湖水战。当时，陈友谅的战舰大呀！
陈友谅战舰“高数丈”、“上下三层，每层都可以骑马来往”。在攻击太平时，陈友谅直接将船开到太平城靠江的城墙边，用短梯从容地爬上了城头。另外，“这种战船上下之间的隔音效果非常好，上下面只隔一层木板，然而，下面却听不到上面的说话声”，“这种设计非常科学，上面打得天翻地覆，下面还能保持动力”，“即便上面吃了败仗，下面还是照样会拼命”。
面对三倍于已的敌兵，朱元璋迎难而上，他先后运用了设伏、火攻等战术，凭借着悍不畏死的团队，大败陈友谅。
清太祖英武天纵，作为北方人，当他看到那些巨无霸的战舰，应该会不太适应吧！
第五，明太祖征伐的难度更大
朱元璋统一天下，是从南往北打，这比从北往南打更难。为什么呢？
主要是因为北方的地势开阔、相对平坦。当具有足够的军事实力和指挥才能时，平定北方推进速度快。一旦整合了北方势力后，夺取南方就指日可待了。
历史上有众多从北往南打的成功案例，但从南往北打，成功的只有朱元璋一例，蒋先生勉强成功了一半。
南方势力不容易整合，因为南方多丘陵地带，并且山脉水网交织，各方势力据险固守，没有逆天的本领，成不了事。
第六，在将将的能力上，朱元璋更胜一筹
清太祖和明成祖有点像，打起仗上都喜欢亲自动手，然而战场无情，终归有闪失的时候。譬如说努尔哈赤先生，因为有长白山人参打下的底子，身体健硕，67岁高龄都带兵亲征。
明太祖40岁以后，就不再御驾亲征了，因为他培养了一大批可以独挡一面的将才。
在洪武年间，明朝有8次北伐，先后使用的统帅型人才有：徐达、李文忠、冯胜、沐英、朱棣、蓝玉、傅友德、唐胜宗、郭英等等。手下猛将如云，真是让人羡慕呀！
结语：
虽然明太祖和清太祖同归太祖的级别，但其实差距挺大的。清太祖和明太祖之间，至少隔着五个人。
其一，皇太极，补上威服朝鲜这一课；其二，多尔衮，补上宁远绝地这一课；其三，顺治，补上入主关内这一课；其四，康熙，补上大型水战这一课；其五，雍正，补上刷新吏治这一课。
以上，是我的真实想法。究我本心，很想夸夸清太祖，然而，实力它真的不允许呀，请恕我爱莫能助。
个人观点朱元璋会获胜。
首先二人的出身就不一样，朱元璋出身贫民，他能当上皇帝是完全靠自己的努力得来的，所以朱元璋的能力没有半点虚假；努尔哈赤起点就比朱元璋高，他虽是少数民族，但也是个女真贵族，如果让他像朱元璋那样没有背景，独自闯荡，可能都不会有大清。从个人能力来比较，朱元璋要完胜努尔哈赤。
其次，二人所遇到的对手实力不一样。朱元璋有所成就的时候，他身边的对手实力都比他强大，他要面对北方元朝的蒙古骑兵，要面对长江上游的陈友谅，下游的张士诚，东南边还的方国珍，可谓四面受敌。特别是鄱阳湖水战，朱元璋以二十万兵力打败了陈友谅六十五万大军，这是中国历史上经典的以少胜多的战役了。而且朱元璋还做到了中国历史第一次由南到北统的大统一，之前从来没有人能做到过。
而反观努尔哈赤，他就没有遇到像朱元璋这样强大的对手。努尔哈赤在统一女真的时，那些都是小部落，没有大规模战争。他能拿得出手的就是萨尔浒战役了，以六万兵力战胜了明军的十一万人，但这与朱元璋在鄱阳湖大战中所处的弱势还是没办法相比。
努尔哈赤最终是被袁崇焕的红衣大炮打成重伤，后来没多久就死了，也没能统一全国，而朱元璋则更为厉害，他打败了所有敌人，统一了全国，建立了大明。
第三就是所拥有的人才，朱元璋麾下人才济济，武将有徐达、常遇春、汤和、沐英等；谋士有李善长、刘伯温等，这些都是人们耳熟能详的人物。反观努尔哈赤这边，就没有几个能拿得出手的猛将或谋士了。
所以从个人能力，个人战绩，所有用的人才等几方面来看，如果朱元璋与努尔哈赤交手，那朱元璋获胜的可能性极大。
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