明朝后期军队实力下降是多方面的原因，有天灾也有人祸，绝对不能一概而论。天灾是明末鼠疫使人口锐减，西北连年旱灾逼反灾民。人祸是朝廷内部腐败，后金势力的崛起。究其原因，主要是以下几点：
第一，财政问题首当其冲。明朝时期纸币不被社会所承认，当时的货币是银，而中国人民又有存钱的习惯，这导致了社会上流通的银钱越来越少。虽然海外贸易能在一定程度上弥补银的不足，但一来政府遵守朱元璋的祖制实行海禁，另一方面海外贸易只能将财富流入东南沿海的富户手中，很大程度上无法成为政府的财政收入。另外也增加了社会贫富差距。
大明王朝一年财政收入是两千多万两白银，最多不超过三千万两。如果对这个数字没有概念，那可以说北宋年收入在1.5亿两白银左右。所以北宋对外战争时赔点钱还能过下去，但明朝没有钱连军队都维持不住，更不用提保持战斗力了。
第二，明中期开始，土地兼并日益严重。王公贵族、官吏和富商利用各种手段侵占土地，这不仅大大加剧了社会矛盾，也严重影响了国家收入。有权势的官僚和富商侵占土地后利用各种方法拒不缴税，朝廷只好将这些负担再增加于普通百姓身上，进一步加重百姓负担。
这就造成了“国穷民富”的现象。明朝政府过于依赖“田赋”，但随着资本主义萌芽的兴起这种征税方式以及落后。这就造成了拥有大量财富的富商不用纳税，另一方面经济不发达的地区税负却过重。虽然明朝后期几个皇帝都曾试图对东南沿海富商加税，但由于此地科举同样发达导致朝中文官多出于此。文官的反对使多次加税改革无功而返。
第三，热兵器虽然威力远胜于冷兵器，但其成本巨大。弓箭可以反复使用，子弹却开一枪少一发。枪支、子弹、大炮、炮弹对金属和火药的消耗是十分巨大的，且铸造要求极高。在技术尚不发达的明代制造枪支和大炮的损耗就已经相当巨大，更不用提训练和实战了。
比如说在1592年，明朝军队用热武器狠狠打击了日本军队，但在二十年后的萨尔浒之战中几乎全军覆没。其中如刘铤、李如柏等指挥官都没有变，军队也没有变，最大的变化就是明朝已经无法向万历对日本时无限制的使用火器了。
明朝中后期为何无法对抗八旗铁骑
游牧民族的骑兵对农耕民族的步兵是有先天优势的，很幸运的明朝人找到了克制骑兵的办法，那就是火器。但火器部队是要由钱打造的，多重因素共同导致明朝军队战斗力下降，最终导致明朝灭亡。
感谢提问。
首先明朝中后期并不是无法对抗八旗，而是找到了方法的。这个方法就是关宁锦防线，自始至终，清朝始终未能突破明朝在关宁锦防线的防御，而是选择了从长城一线进入关内。
萨尔浒之战
公元1618年，实力膨胀的后金趁明朝内部党争激烈，农民起义此起彼伏之际，努尔哈赤决定对明朝用兵。
1619年，明朝接连丢失了抚顺、清河等战略要地，万历皇帝深感事态超出了控制，决定对后金采取战略行动。
二月伊始，在万历的多次催促下，明军兵分四路向后金进发，明军总兵力约十一万，包含了叶赫和朝鲜的兄弟部队，但是因为分兵前进，兵力相对分散。
努尔哈赤的八旗大约有六万人，但是其优势在于兵力集中。
双方在萨尔浒附近发起大战，努尔哈赤采取集中优势兵力逐个击破的策略，明军大败。萨尔浒之战的失败使得明军丧失了对后金的战略优势，明军开始转攻为守。
“是役也，明倾天下之力，尽征宿将猛士，及朝鲜叶赫精锐，分道深入，使之不能兼顾。而努尔哈赤以八旗六万之众，先破其一路，五日之间，全军皆败。金士卒仅伤数百人，而所获则以巨万计。明清之兴亡，此亦最大关键也。”
孙承宗与袁崇焕
朱由校即位后，孙承宗来到了辽东，主持辽东地区的防务。
孙承宗在辽东主要干了三件事，而就是这三件事，成功阻挡了后金的脚步，甚至是间接造成了努尔哈赤的驾崩。
- 提拔人才。孙承宗在辽东发现了一个人才，这个人是袁崇焕。袁崇焕虽然不是武将出身，但是却有着卓越的军事天赋，通俗的讲这是一个儒将。而且袁崇焕得到了孙承宗的悉心传授，当孙承宗回到北京时，袁崇焕已经可以独当一面。
- 筑城。严格意义上来说，城是袁崇焕和孙承宗两个人修建的，而且不是单一的一座城，而是一群，也叫关宁锦防线。
- 练兵。后金军队以骑兵为主，而对付骑兵最好的办法就是训练一支同样强大的骑兵。在孙承宗的支持下，袁崇焕从逃亡的难民和士兵中，选取精壮的，对后金苦大仇深的，建立起了一支强大的骑兵，这就是关宁铁骑。
宁锦大战
1626年努尔哈赤再度进攻宁远，而且带来的是他的全部家当。而袁崇焕的家当就是修筑好的宁远城，新式的红衣大炮以及必死的决心。
袁崇焕告诉所有人，不会有援兵，不会有帮手，宁远已经被彻底抛弃。 他将坚守在这里，直到最后一刻。
由于宁远的城墙结构，导致了后金进攻时遭遇了多维打击，防守的明君凭借智慧与决心抵挡了一批又一批后金军队。
努尔哈赤在连番攻击无果后，只得撤军，七个月后，撒手人寰。
不仅仅是努尔哈赤，他的继任者皇太极也在关宁锦防线下吃了败仗，饮恨而归。
结语
从李成梁到孙承宗再到袁崇焕哪怕是后来的吴三桂，后金从来都没有蹦哒的太欢。
关宁防线的存在，始终是后金不可逾越的存在，正因为如此，皇太极才改变了策略，选择先收复蒙古，从长城一线攻入关内，使得明朝惶恐不已，也间接造成了袁崇焕的冤屈。
袁崇焕死后，辽东地区群龙无首，关宁防线无法形成统一阵线，给了后金可乘之机，逐步蚕食。但是直到明朝灭亡之前，后金军队始终没有突破明朝在辽东的防御。
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